Online spēlētāji veicina Hiv izrāvienu | happilyeverafter-weddings.com

Online spēlētāji veicina Hiv izrāvienu

Molekulas, kas ir būtiskas HIV izplatībai, daudzveidība, ko dekodē spēlētāji, struktūra

Bioķīmiķi gadiem ilgi strādā, lai noteiktu molekulas struktūru, kas pazīstama kā HIV-1 proteāze. Proteāze ir enzīms, kas "piespiež" garu aminoskābju ķēdes, kuras vīruss ir izveidojis mazākās aminoskābju ķēdēs, kas pazīstamas kā virions. Virioni spēj inficēt jaunas šūnas un iegūt jaunus proteīnus. Ja vīruss nekad netiek "noņemts" ar proteāžu, tas paliek spolēts gara, inerta ķēdē, kas nevar inficēt jaunas šūnas.


hiv_ribon.jpg
Kā jūs varat iedomāties, proteāzes inhibitori ir galvenais AIDS ārstēšanas mērķis. Zinātnieki gandrīz 15 gadus ir mēģinājuši noskaidrot HIV-1 proteāzes ģeometriju. Tiešsaistes spēlētāji tikai trīs nedēļu laikā dekodēja molekulas struktūru.

Zinātnieki jau zināja, ka HIV-1 proteāzes izvietošana bija kaut kas līdzīgs hanteles, ar diviem lielākiem, salocītiem galiem, kas vidū savienoti ar vairāk vai mazāk taisnu aminoskābju ķēdi. Viņi zināja, ka "snaiperis" hanteles abos galos bija asparagīnskābe. Bet viņi nezināja, kā ferments atrodas pašā tā, ka asparagīnskābe pārtrauc ilgstošos neaktīvos vīrusus mazākās aktīvās daļās.

Lasīt tālāk: Zaļie kvēlojošie kaķi palīdzēs HIV pētījumos

Lai iegūtu ieskatu enzīma ģeometrijā, pētnieki Vašingtonas Universitātes Vašingtonas AIDS pētnieka Dr. David Baker laboratorijā izstrādāja spēli ar nosaukumu Foldit. Viņu ideja bija pieskarties milzīgajām intelektuālajām enerģijām, ko tiešsaistes spēlētāji ievietoja savās spēlēs.


Foldit ir virkne spēļu (vai apmācības) par to, kā olbaltumvielas spolē un atdalās šūnā. Viņi sāk ar "One Small Clash" un strādā līdz pat "Gumijas joslas maiņai".

Gamers sniedz pamatinformāciju par to, kā atsevišķās olbaltumvielu aminoskābes var piesaistīt vai atbaidīt viens otru, un pēc tam tās tiek apzīmētas ar aminoskābju sekvencēm reālās olbaltumvielās ar zināmu ģeometriju, lai tās "salocītu". Viņi ir aicināti mēģināt izgatavot olbaltumvielu, kas attēlots uz ekrāna cilpas vai vaigās. Tie var dubultot proteīna garumu, veidojot spirāli. Viņi var kratīt olbaltumvielu, strādāt tikai ar olbaltumvielu segmentiem, iesaldēt un atsaldēt segmentus un ieviest savstarpējas saites, lai kopā turētu olbaltumvielu. Tie var padarīt olbaltumvielu vairāk vai mazāk kompaktu un izmantot atcelšanas rīku, lai noskaidrotu, kuras no olbaltumvielu daļām varētu tikt apstrādātas vairāk.

Spēle rada rezultātu, pamatojoties uz to, cik labi olbaltumviela ir salocīta salīdzinājumā ar to, ko zinātnieki jau zina, un vietne saglabā sarakstu ar augstu vērtējumu spēlētājiem. Spēlīgie spēlētāji var kopīgot risinājumus un veidot grupas vai savstarpēji konkurēt atsevišķi. Pēc tam zinātnieki analizē to, kā spēlētāji pieņēma lēmumus par locīšanas proteīniem, lai uzrakstītu jaunus datora algoritmus, lai izskaidrotu vēl nezināmu olbaltumvielu struktūru.

Foldit ir bijis tiešsaistē kopš 2008. gada. Proteāzes enzīma struktūra ir ceturtais zinātniskais sasniegums, kas veikts, izmantojot tiešsaistes spēlētājus. Ja zinātniekiem nav pietiekami daudz bruto skaitļošanas jaudas, lai saprastu problēmu, Foldit un līdzīgi rīki padara zinātnisku atklājumu par iespējamu, izmantojot crowdsourcing.
#respond